资源简介 第1节重组DNA技术 的基本工具 从社会中来 番木瓜容易受番木瓜环斑病毒的侵袭,当番木瓜被这种病毒感染后,产量会大大下降。科学家通过精心设计,用“分子工具”培育出了转基因番木瓜,它可以抵御番木瓜环斑病毒DNA双螺旋的直径只有2 nm,对如此微小的分子进行操作,是一项非常精细的工作,更需要专门的“分子工具”。 转基因木瓜 环斑病毒的 非转基因木瓜 限制性内切核酸酶、DNA连接酶,载体。 限制性内切核酸酶: DNA连接酶: 载体: 这些 “分子工具”各具有什么特征呢? 那么,科学家究竟用到了哪些“分子工具”? 准确切割DNA分子,得到所需要的目的基因。 能将目的基因连接到载体上。 能将目的基因导入受体细胞中。 一、限制性内切核酸酶--“分子手术刀” 1、来源: 主要从原核生物中分离纯化出来 2、种类: 迄今分离的限制酶有数千种 3、作用特点: 具有专一性。具体表现如下 4、作用部位: 特定切点上的磷酸二酯键 5' 3' 5' 3' T A G G T A T C C A 磷酸二酯键 ①能够识别双链DNA分子中特定的核苷酸序列。 ②使每一条链中特定部位的磷酸二酯键断开。 5、两种常用的限制酶: 限制酶的命名是根据细菌种类而定,以EcoRI为例: E:Escherichia (属) co:coli (种) R:RY13 (品系) I:首先发现 在此类细菌中发现的顺序 EcoRⅠ:大肠杆菌(Escherichia coli)R型菌株中分离出的第一个限制酶; SmaⅠ:粘质沙雷氏菌(Serratia marcescens)中分离出的第一个限制酶。 EcoRⅠ和SmaⅠ 黏性末端 黏性末端 (1)EcoRI限制酶的切割: 当限制酶在它识别序列得中轴线两侧将DNA分子的两条链分别切开时,产生的是黏性末端。 只能识别GAATTC序列,并在G和A之间切开。 中轴线 中轴线 (2)SmaI限制酶的作用 只能识别CCCGGG序列,并在C和G之间切开。 当限制酶在它识别序列中轴线处切开时,产生的是平末端。 在C和G之间切开 6、结果: 产生黏性末端或平末端 7、限制酶的识别序列的特点 (1)大多数限制酶的识别序列由6个核苷酸组成。例如:EcoRⅠ、SmaⅠ (2)少数限制酶的识别序列由4个、8个或其他数量的核苷酸组成 (3)限制酶特异性识别和切割的部位具有回文序列 1.你能推测限制酶存在于原核生物中的作用是什么吗? 破坏外源DNA,保护自我 2.为什么限制酶不剪切细菌本身的DNA? 缺乏特定的核苷酸序列 思考·讨论 3.请写出下列限制酶切割形成的黏性末端,并思考同种限制酶切割产生的黏性末端是否相同?不同限制酶切割产生的黏性末端是否一定不同? 同种限制酶产生的黏性末端相同, 不同的限制酶可能会形成相同的黏性末端。 4.请结合下图,推断限制酶切一次可断开几个磷酸二酯键?产生多少游离的磷酸基团?产生几个黏性末端?消耗几分子水? 断开两个磷酸二酯键;产生2个游离的磷酸基团; 产生2个黏性末端;消耗两分子水。 EcoRⅠ 黏性末端 ……CTACGATGAATTCCGTAGAATTCCCTAA…… ……GATGCTACTTAAGGCATCTTAAGGGATT…… ……CTACGATG ……GATGCTACTTAA AATTCCCTAA…… GGGATT…… AATTCCGTAG GGCATCTTAA 黏性 末端 目的基因 练习:使用EcoRI剪切目的基因 G A A T T C C T T A A G G A A T T C C T T A A G G C T T A A A A T T C G G C T T A A A A T T C G 用同种限制酶切割(EcoRⅠ) 把两种来源不同的DNA进行重组,应该怎样处理? 缺口怎么办? G C T T A A A A T T C G G C T T A A A A T T C G 二、DNA连接酶--“分子缝合针” 把切下来的DNA片段拼接成新的DNA分子,是靠DNA连接酶来完成的。即将双链DNA片段“缝合”起来,恢复被限制酶切开的 。 DNA连接酶主要有两类 : 、 。 2. E.coli DNA连接酶 T4 DNA连接酶 磷酸二酯键 1.DNA连接酶的作用 A G T C A T T C G A T A 可把黏性末端之间的缝隙“缝合”起来; (1)E.coli DNA连接酶 两DNA片段要具有互补的黏性末端才能拼起来。 注意:DNA连接酶可连接双链DNA中的DNA单链缺口,但不能将单个脱氧核苷酸连接到DNA链上! (2)T4 DNA连接酶 还可把平末端之间的缝隙“缝合”起来,但效率较低 C C C G G G G G G C C C DNA连接酶--“分子缝合针” 2 类型 来源 功能 相同点 差别 E·coli DNA连接酶 T4DNA连接酶 大肠杆菌 T4噬菌体 恢复磷酸二酯键 只能连接黏性末端 能连接黏性末端和 平末端(效率较低) DNA连接酶 DNA连接酶 A T A G T C C G A A T T 连接两个DNA片段 与DNA聚合酶区别: C A A T T DNA聚合酶 G A G T A T C DNA聚合酶 连接单个脱氧核苷酸形成单链 DNA连接酶 DNA聚合酶 相同点 作用实质 化学本质 不 同 点 模板 作用对象 作用结果 用途 都能催化形成磷酸二酯键 都是蛋白质 不需要 需要 形成完整的重组DNA分子 形成DNA的一条链 基因工程 DNA复制 3 DNA连接酶与DNA聚合酶的比较 只能将单个脱氧核苷酸连接到已有的DNA片段上,形成磷酸二酯键 在两个DNA片段之间形成磷酸二酯键 名称 作用部位 作用结果 限制酶 磷酸二酯键 将DNA切成两个片段 DNA连接酶 磷酸二酯键 将两个DNA片段连接为一个DNA分子 DNA聚合酶 磷酸二酯键 将单个脱氧核苷酸依次连接到单链末端 DNA(水解)酶 磷酸二酯键 将DNA片段水解为单个脱氧核苷酸 解旋酶 碱基对之间 的氢键 将双链DNA分子局部解旋为单链,形成两条长链 归纳总结 与DNA相关的五种酶的比较 根据所学知识,完成以下填空: ①限制酶 ②解旋酶 ③DNA连接酶 ④DNA聚合酶 ⑤RNA聚合酶 b a A.切断a处的酶为_______ B.连接a处的酶为_______ C.切断b处的酶为_______ ① ③④⑤ ② a:磷酸二酯键;b:氢键 练习: 工具 分子手术刀 分子缝合针 分子运输车 限制性内切核酸酶: DNA连接酶: 载体: 准确切割DNA分子 得到所需要的目的基因 将DNA片段连接起来 即能将目的基因连接到载体上 将体外重组好的DNA分子导入受体细胞(即能将目的基因导入受体细胞中) 质粒(最常用) 作为载体,将外源基因送入受体细胞。 1.作用: 动植物病毒 噬菌体 2.种类: 三、基因进入受体细胞的载体——分子运输车 质粒是一种裸露的、结构简单的、独立于真核细胞细胞核或原核细胞拟核DNA之外,并具有自我复制能力的双链环状DNA分子。 3、载体需具备的条件 (1)有一个至多个限制酶切割位点,供外源DNA插入其中。 (2)能在细胞中进行自我复制, 或整合到受体DNA上随DNA同步复制 (3)有特殊的标记基因,便于重组DNA的筛选。 如四环素抗性基因、氨苄青霉素抗性基因。 (4)对受体细胞无毒害作用,避免受体细胞受到损伤 实际上自然存在的质粒DNA分子并不完全具备上述条件,都要进行人工改造后才能用于基因工程操作。 标记基因的筛选原理 载体上的标记基因一般是某种抗生素的抗性基因,而受体细胞没有抵抗该抗生素的能力。将含有某抗生素抗性基因的载体导入受体细胞,抗性基因在受体细胞内表达,受体细胞对该抗生素产生抗性。在含有该抗生素的培养基上,能够生存的是被导入了载体的受体细胞。如图所示: …ATAGCATGCTATCCATG AATTCGGCATAC… …TATCGTACGATAGGTACTTAA GCCGTATG… 目的基因 … TCCTAG … AGGATCTTAA AATTCCATAC … GAGCCATACTTAA AATTCTCGGTATG GGTATG … 实例:重组DNA分子的模拟操作 AATTCGGCATAC… …TATCGTACGATAGGTACTTAA …ATAGCATGCTATCCATG 目的基因 … TCCTAG … AGGATCTTAA AATTCCATAC … GAGCCATACTTAA AATTCTCGGTATG GGTATG … GCCGTATG… {5C22544A-7EE6-4342-B048-85BDC9FD1C3A} 载体的作用 载体的 必要条件 载体的种类 ①具一个或多个限制酶切点,以便与外源基因连接。 ②能在宿主细胞中自我复制 或整合到受体DNA上随受体DNA复制 ③具有某些标记基因,便于重组DNA的筛选。 ①作为运载工具,将目的基因导入受体细胞中 ②在受体细胞内对目的基因进行大量复制 ①质粒 ②病毒:噬菌体、动植物病毒等。 三、基因进入受体细胞的载体--“分子运输车” 本节小结 基因工程 的工具 限制酶 主要存在于原核生物中 具有专一性(识别序列) 切开DNA分子的磷酸二酯键 产生黏性末端或平末端 DNA连接酶 连接磷酸二酯键 种类 E.coli DNA连接酶 T4 DNA连接酶 质粒、噬菌体、动植物病毒 载体 具备的 条件 具一种至多种限制酶切点 具标记基因 能在宿主细胞中自我复制 或整合到受体DNA上随受体DNA复制 【典例】1.图甲是含有目的基因的外源DNA片段,图乙是用于将目的基因导入受体细胞的质粒(阴影部分表示抗生素抗性基因),相关限制酶的作用部位如图所示,现欲培养转基因抗病植株,回答下列问题。 (1)上述操作中不宜选用Sma I,原因是Sma I会破坏__________和 __________________。 (2)在基因工程的操作中,不宜选用EcoR I,原因是用EcoR I切割外源DNA片段后,_____________________________________________________。 抗病基因 抗生素抗性基因 目的基因只有一侧含有黏性末端,不能插入到质粒中 2.用限制酶切割时需注意的事项 (1)获取目的基因和切割载体时, 通常使用同种限制酶,目的是 。但是使用该法缺点是容易发生 ,为了避免上述情况发生,可采取的措施是 。 (2)获取一个目的基因需限制酶切割 次,共产生 个游离的磷酸基团。 (3)选择限制酶切割位点的基本原则: ①切割目的基因时: 。 ②切割质粒时: 。 为了产生相同的黏性末端,便于连接 两 4 分别使用两种限制酶去切割目的基因和运载体 目的基因、质粒的自身环化以及目的基因与质粒反向连接 能切下目的基因且不破坏目的基因 至少保留一个完整的标记基因,便于筛选 练习与应用 3.如图是培育表达人乳铁蛋白的乳腺生物反应器的技术路线 用图2中的人乳铁蛋白目的基因和图1所示的质粒构建重组质粒时,选用的限制酶是 (从“EcoRⅠ”“BamHⅠ/HindⅢ”“SmaⅠ/HindⅢ”中选择).不能选择其他限制酶的理由分别是: 。 BamHⅠ/HindⅢ 若选EcoRⅠ会破坏质粒的复制原点;若选SmaⅠ/HindⅢ,则构建的重组质粒没有标记基因或复制原点 (1)限制性内切核酸酶均能特异性地识别6个核苷酸序列( ) (2)DNA连接酶能将两碱基间通过氢键连接起来( ) (3)E.coliDNA连接酶既可连接平末端,又可连接黏性末端( ) (4)限制酶和解旋酶的作用部位相同( ) (5)质粒是双链环状DNA分子,是基因工程常用的载体。( ) × × × × √ 【基础过关】 2.实验原理: 探究·实践·DNA的粗提取与鉴定 (1)DNA不溶于酒精,但某些蛋白质溶于酒精。 (2)DNA在不同浓度的NaCl溶液中溶解度不同,能溶于2mol/L NaCl溶液。 (3)在一定温度下,DNA遇二苯胺试剂会呈现蓝色。 0 0.14 NaCI浓度(mol/L) DNA溶解度 1.实验设计思路: 四 DNA、RNA、蛋白质和脂质等在物理和化学性质方面存在差异,可以利用这些差异,选用适当的物理或化学方法去除其他成分,对DNA进行提取。 探究·实践·DNA的粗提取与鉴定 四 DNA含量相对较高的生物组织,如新鲜洋葱、香蕉、菠菜、菜花和猪肝等。 不能选择哺乳动物成熟的红细胞,因为哺乳动物成熟的红细胞中没有细胞核和线粒体,几乎不含DNA。 3.选材: 注意: 4.试剂: ①研磨液 ②体积分数为95%的酒精 ③2mol/L的NaCl溶液 ④二苯胺试剂 ⑤蒸馏水 ——含有NaCl、EDTA、SDS、Tris和HCl ——析出DNA ——溶解DNA ——鉴定DNA,要现配现用 5.方法步骤 探究·实践·DNA的粗提取与鉴定 四 析出DNA DNA的鉴定 研磨 称取约30g洋葱切碎,放入研钵中,倒入10mL研磨液,充分研磨。 过滤取上清液 在漏斗中垫上纱布,将洋葱研磨液过滤到烧杯中,在4℃冰箱中放置几分钟后,再取上清液。 在上清液中加入体积相等的、预冷的酒精溶液(体积分数为95%),静置2~3min,溶液中出现的白色丝状物就是粗提取的DNA。用玻璃棒沿一个方向搅拌,卷起丝状物,并用滤纸吸去上面的水分; 取两支试管,各加入2mol/L的NaCl溶液5mL。将丝状物或沉淀物溶于其中一支试管的NaCl溶液中。然后,向两支试管中各加入4mL的二苯胺试剂。混合均匀后,将试管置于沸水中加热5min。 方法步骤 (视频) 探究·实践·DNA的粗提取与鉴定 四 注意事项 1.以血液为实验材料时,每100 mL血液中需要加入3 g柠檬酸钠,防止血液凝固。 2.利用动物细胞提取DNA破碎细胞的方法:动物细胞无细胞壁,可直接吸水涨破。 3.加入研磨液后,必须充分研磨,否则细胞核不会充分破碎,释放出的DNA量就会减少。 4.加入酒精和用玻璃棒搅拌时,动作要轻缓,以免加剧DNA分子的断裂,导致DNA分子不能形成絮状沉淀。 5.预冷的酒精具有以下优点:①可抑制核酸水解酶的活性,进而抑制DNA降解;②抑制分子运动,使DNA易形成沉淀析出;③低温有利于增加DNA分子的柔韧性,减少其断裂。 探究·实践·DNA的粗提取与鉴定 四 1.你提取出白色丝状物或沉淀物了吗?用二苯胺试剂鉴定的结果如何? 2.你能分析出粗提取的DNA中可能含有哪些杂质吗? 结果分析与评价 观察提取的DNA的颜色,如果不是白色丝状物,说明DNA中的杂质较多。二苯胺试剂鉴定呈现蓝色说明实验基本成功;如果不呈现蓝色,可能的原因有所提取的DNA含量低,或者在实验操作过程中出现了失误等。 本实验粗提取的DNA可能仍然含有核蛋白、多糖等杂质。 探究·实践·DNA的粗提取与鉴定 四 进一步探究 实验室提取纯度较高的DNA的方法有不少。例如,可以先添加质量分数为25%的SDS溶液,使蛋白质变性后与DNA分开;随后,加入氯仿—异丙醇混合液(体积比为24:1),通过离心将蛋白质及其他杂质除去,取上清液;可重复上述操作几次,直至上清液变成透明的黏稠液体。此外由于苯酚可以迅速使蛋白质变性,抑制核酸酶的活性,因此还可以先用苯酚处理,然后离心分层,这时DNA溶于上层水相,蛋白质变性后存在于酚层中,用吸管、微量移液器等实验用具就可以将两者分开。 探究·实践·DNA的粗提取与鉴定 四 3.与其他同学提取的DNA进行比较,看看实验结果有何不同,分析产生差异的原因。 刑侦破案 拓展:DNA提取的应用 基因组测序 插入人胰岛素基因的大肠杆菌 基因工程 亲子鉴定 探究·实践·DNA的粗提取与鉴定 四 练习与应用 一、概念检测 1.DNA连接酶是重组DNA技术常用的一种工具酶。下列相关叙述正确的是 A.能连接DNA分子双链碱基对之间的氢键 B.能将单个脱氧核苷酸加到DNA片段的末端,形成磷酸二酯键 C.能连接用同种限制酶切开的两条DNA片段,重新形成磷酸二酯键 D.只能连接双链DNA片段互补的黏性末端,不能连接双链DNA片段的平末端 2.在重组DNA技术中,将外源基因送入受体细胞的载体可以是 A.大肠杆菌的质粒 B.切割DNA分子的酶 C.DNA片段的黏性末端 D. 用来识别特定基因的DNA探针 C A 二、拓展应用 1.想一想,为什么限制酶不切割细菌本身的DNA分子? 提示:细菌中限制酶之所以不切割自身的DNA,是因为含有某种限制酶的细胞的DNA分子不具备这种限制酶的识别序列,或者通过甲基化酶将甲基转移到了限制酶所识别序列的碱基上,使限制酶不能将其切开。这样,尽管细菌中含有某种限制酶,也不会使自身的DNA被切断,并且可以防止外源DNA入侵。 2.有2个不同来源的DNA片段A和B,A片段用限制酶SpeI进行切割,B片段分别用限制酶HindⅢ、XbaI、EcoRV和XhoI进行切割。各限制酶的识别序列和切割位点如下。 (1)哪种限制酶切割B片段产生的DNA片段能与限制酶SpeI切割A片段产生的DNA片段相连接?为什么? XbaⅠ。因为XbaI与SpeI切割产生了相同的黏性末端。 2.有2个不同来源的DNA片段A和B,A片段用限制酶SpeI进行切割,B片段分别用限制酶HindⅢ、XbaI、EcoRV和XhoI进行切割。各限制酶的识别序列和切割位点如下。 (2)不同的限制酶切割可能产生相同的黏性末端,这在基因工程操作中有什么意义? 提示:识别DNA分子中不同核苷酸序列,但能切割产生相同黏性末端的限制酶被称为同尾酶。同尾酶使构建载体时,切割位点的选择范围扩大。例如,我们选择了用某种限制酶切割载体,如果目的基因的核苷酸序列中恰好含有该限制酶的识别序列,那么用该限制酶切割含有目的基因的DNA片段时,目的基因就很可能被切断;这时可以考虑用合适的同尾酶(目的基因的核苷酸序列中不能有它的识别序列)来获取目的基因。 展开更多...... 收起↑ 资源预览