3.2基因工程的基本操作程序课件(共27张PPT2个视频)

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(共27张PPT)
第三章
基因工程
第2节
基因工程的基本操作程序
学生实践展示
从实践中学
从实践中学
1997年,我国政府首次批准商业化种植转基因抗虫棉。到2015年,我国已育成转基因抗虫棉品种100多个,减少农药用量40万吨,增收节支社会经济效益450亿元。
你知道转基因抗虫棉的机制是什么吗?培育转基因抗虫棉一般需要哪些步骤?
从社会中来
▲ 普通棉桃(左)和转基因抗虫棉桃(右)
抗虫机制:
转基因抗虫棉的抗虫机制及培育过程
Bt 抗虫蛋白赋予棉花抗虫能力
苏云金杆菌
Bt 抗虫蛋白
破坏鳞翅目昆虫的消化系统来杀死棉铃虫
培育过程:
苏云金杆菌
Bt 抗虫蛋白基因
提取
与载体拼接
导入
棉花细胞
抗虫棉
表达
Bt基因的筛选与获取
Bt基因表达载体的构建
将Bt基因导入受体细胞
Bt基因的检测与鉴定
第一步:Bt基因的筛选与获取
Bt 抗虫蛋白基因(Bt基因)
1. 目的基因:
是编码Bt抗虫蛋白质的基因
也可以是具有调控Bt基因的因子
第一步:Bt基因的筛选与获取
2. 筛选Bt基因:
可以从苏云金杆菌中筛选Bt基因。
还可以利用序列数据库(如GenBank)、序列对比工具(如BLAST)等,找到Bt基因。
问题:筛选出来的目的基因如何获取呢?
第一步:Bt基因的筛选与获取
3. 获取Bt基因的方法:
(1)人工合成Bt基因
在明确Bt基因碱基序列的基础上,利用 DNA 合成仪自动化合成所需的 DNA片段。
▲ DNA 合成仪
注:仅适用于较短的DNA。
将含有某种生物不同基因的许多DNA片段,结合质粒导入受体菌群体中储存,这个受体菌群就是该生物的基因文库。
第一步:Bt基因的筛选与获取
(2)从基因文库中获取
苏云金杆菌
基因组 DNA
DNA片段
限制酶
酶切
与载体重组
导入
mRNA
逆转录
cDNA
与载体重组
导入
基因组
文库
cDNA
文库
基因文库
提取
提取
第一步:Bt基因的筛选与获取
(3)利用 PCR 特异性地快速扩增Bt基因
① 概念:
PCR是聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction)的缩写。它是一项在体外提供参与DNA复制的各种组分与反应条件,对目的基因的核苷酸序列进行大量复制的技术。
② 原理:
DNA半保留复制
③ 优点:
可以短时间内大量扩增目的基因
凯利·穆里斯
(1944.12-2019.8.7)
④ 条件:
第一步:Bt基因的筛选与获取
体内 DNA 复制参与的组分 在 DNA 复制中的作用 PCR 中参与的组分
打开 DNA 双链
提供 DNA 复制的模板
合成子链的原料
催化合成 DNA 子链
维持 pH 稳定
激活 DNA 聚合酶
使 DNA 聚合酶能够从引物的3' 端开始连接脱氧核苷酸
解旋酶
DNA 母链
4种脱氧核苷酸(实为dNTP)
DNA 聚合酶
缓冲物质
Mg2+
引物(短的单链 RNA)
无需解旋酶,用高温代替
DNA 母链
4种脱氧核苷酸(实为dNTP)
耐高温的 DNA 聚合酶
缓冲液
Mg2+
引物(2种,短的单链 DNA)
解旋
RNA引物
冈崎片段
▲ 体内DNA 复制过程(部分)
3'
5'
3'
5'
5'
3'
3'
5'
5'
3'
3'
5'
第一步:Bt基因的筛选与获取
相关信息——引物
引物是一小段能与DNA母链的一段碱基序列互补配对的短单链核酸。DNA双链解旋之后DNA聚合酶无法直接聚合游离的脱氧核苷酸,必须由引物提供 3' 端之后才能开始连接脱氧核苷酸。由于DNA双链是反向平行的,所以 PCR 需要 2 种引物。
引物的作用:使DNA聚合酶能从引物的 3' 开始连接脱氧核苷酸,启动DNA的复制。
注:PCR中的引物为短单链 DNA,通常含20~30个核苷酸。
第一步:Bt基因的筛选与获取
DNA片段
第一步:Bt基因的筛选与获取
⑤ 过程:
变性
复性
延伸
思考·讨论
PCR 扩增的是完整的模板 DNA 分子吗?
由此可知在扩增目的基因时,引物是根据什么来设计的?
不是
扩增的是两种引物之间所对应的特定DNA片段;
引物是根据目的基因两端的(或两条链3'部分)核苷酸序列来设计的。
第一步:Bt基因的筛选与获取
引物设计要求:
a. 引物自身不能环化(即引物自身内部不能形成局部双链)
b. 两种引物之间不能互补配对
c. 引物长度不宜过短或过长,防止出现引物与模板的非特异性结合
d. 引物的 GC 含量不宜太高(通常建议在40%-60%之间),且两种引物之间GC含量(或比例)要相当,以免出现复性温度不统一
1.某实验利用PCR技术获取目的基因,实验结果显示除目的基因条带(引物与模板完全配对)外,还有2条非特异条带(引物和模板不完全配对)。为了减少反应非特异条带的产生,以下措施中有效的是( )
A.增加模板DNA的量
B.延长热变性的时间
C.延长延伸的时间
D.提高复性的温度
习题巩固
D
2.为了对重金属污染的土壤进行生物修复,研究者将从杨树中克隆的重金属转运蛋白(HMA3)基因与外源高效启动子连接,导入杨树基因组中(如图)。为检测获得的转基因杨树苗中是否含有导入的HMA3基因,同时避免内源HMA3基因的干扰,在进行PCR扩增时,应选择的引物组合是( )
A.①+③ B.①+② C.③+② D.③+④
习题巩固
B
获取了足够量的 Bt 基因后,能不能直接将它导入受体细胞呢?
不能。游离的 DNA 进入受体细胞,一般会直接被分解,即使可以转录翻译成蛋白质,游离的 DNA 片段也无法随着细胞分裂而进行复制,导致子代细胞中不再含有目的基因。
第二步:基因表达载体的构建
1. 目的:
让目的基因在受体细胞中稳定存在,并且可以遗传给下一代;
使目的基因能够在受体细胞中表达和发挥作用。
基因表达载体的构建是基因工程的核心工作。
第二步:基因表达载体的构建
2. 组成:
基因表达载体
标记基因
复制原点
终止子
启动子
插入目的基因
位于基因的上游;
RNA 聚合酶识别和结合的部位,驱动基因转录出 mRNA
DNA 复制的起始位点
人们所需要的基因
位于基因的下游;
终止转录
便于重组 DNA 分子的筛选(将含有目的基因的受体细胞筛选出来)
非编
码区
非编
码区
原核生物基因
启动子
终止子
编码区
非编
码区
非编
码区
真核生物基因
启动子
终止子
编码区
外显子
内含子
【拓展延伸】
真、原核生物基因的结构及转录和加工过程
转 录
前体mRNA
加 工
成熟mRNA
转 录
mRNA
注意:启动子和终止子都是DNA序列,而起始密码子和终止密码子则位于mRNA上,分别是翻译的起点和终点。
【拓展延伸】
启动子的类型(根据转录模式分)
① 组成型启动子
这类启动子一般来自管家基因,可连续不断地启动基因的表达。
② 组织特异性启动子
其调控作用使基因往往只在某些特定器官或组织中表达,且表现出发育调节的特性。
③ 诱导型启动子
当诱导物存在时,可以激活或抑制目的基因的表达。
分析基因表达载体构建的方法
(1)构建基因表达载体时,能否用 Sma Ⅰ 限制酶切割质粒?为什么?
不能;因为 SmaⅠ 切割会破坏质粒的抗生素抗性基因(抗生素抗性基因是质粒上的标记基因,若被破坏,无法进一步筛选重组 DNA 分子)。
质粒
抗生素
抗性基因
Sma Ⅰ
BamH Ⅰ
Hind Ⅲ
EcoR Ⅰ
图1
EcoR Ⅰ
EcoR Ⅰ
目的基因
BamH Ⅰ
Hind Ⅲ
外源 DNA
图2
分析基因表达载体构建的方法
(2)若只用 EcoR Ⅰ 限制酶切质粒和外源 DNA,则构建基因表达载体时会出现哪些结果?
质粒自身环化
正向连接
反向连接
目的基因多拷贝与质粒连接
质粒
抗生素
抗性基因
Sma Ⅰ
BamH Ⅰ
Hind Ⅲ
EcoR Ⅰ
图1
EcoR Ⅰ
EcoR Ⅰ
目的基因
BamH Ⅰ
Hind Ⅲ
外源 DNA
图2
分析基因表达载体构建的方法
(3)为避免出现上述情况可以选择什么限制酶对质粒和外源 DNA 进行切割?
使用 BamHⅠ和 Hind Ⅲ两种限制酶同时处理质粒、外源DNA。
质粒
抗生素
抗性基因
Sma Ⅰ
BamH Ⅰ
Hind Ⅲ
EcoR Ⅰ
图1
EcoR Ⅰ
EcoR Ⅰ
目的基因
BamH Ⅰ
Hind Ⅲ
外源 DNA
图2
优点:①避免质粒自身环化;②有利于载体与目的基因正向连接,避免反向连接。
双酶切法
分析基因表达载体构建的方法
问题:若目的基因两端无合适的限制酶切割位点怎么办?
5'
3'
3'
5'
5'
3'
3'
5'
5'
3'
5'
3'
5'
5'
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3'
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3'
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3'
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3'
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5'
3'
5'
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3'
3'
5'
3'
5'
3'
3'
5'
3'
3'
引入限制酶识别序列
课堂小结

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