3,1重组DNA技术的基本工具课件(共49张PPT)

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3,1重组DNA技术的基本工具课件(共49张PPT)

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(共49张PPT)
§3-1 重组DNA技术的基本工具
基因工程
抗虫棉
棉花细胞
普通棉花
(无抗虫特征)
(含抗虫基因)
棉花植株
(有抗虫特征)
基因工程
抗虫基因
提取
苏云金芽孢杆菌(简称Bt)
(有抗虫特征)


别 名 基因拼接技术
或DNA重组技术
操作环境 生物体外
操作对象 基 因
操作水平 DNA分子水平
基本过程 剪切→拼接→导入→表达
结 果 人类需要的基因产物
原 理 基因重组(广义)
基因工程的概念考点解析:
优点:
定向改造生物体的性状(目的性强)
基因重组的三种类型
①减数第一次分裂前期:同源染色体上的非等位基因重组
②减数第一次分裂后期:非同源染色体上的非等位基因重组
③基因工程操作导致的基因重组
①不同生物的DNA能够进行拼接吗?
②Bt基因在棉花细胞中能够表达?
①基因是控制生物性状的遗传物质的结构和功能单位
②遗传信息的传递都遵循中心法则
③生物界共用一套遗传密码
理论基础
苏云
金杆菌
Bt基因
普通棉
花DNA
抗虫棉
提取
导入
表达
能,
①DNA的基本组成单位相同
②都遵循碱基互补配对原则
③DNA分子的空间结构都是规则的双螺旋结构
番木瓜容易受番木瓜环斑病毒的侵袭。当番木瓜被这种病毒感染后,产量会大大下降。科学家通过精心设计,用“分子工具”培育出了转基因番木瓜,它可以抵御番木瓜环斑病毒。
到社会中去
DNA双螺旋的直径只有2nm,对如此微小的分子进行操作,是一项非常精细的工作,更需要专门的“分子工具”。
那么,科学家究竟用到了哪些“分子工具”?
这些“分子工具”各具有什么特征呢?
转基因番木瓜(左)与非转基因番木瓜(右)
“分子手术刀”
准确切割DNA分子
“分子缝合针”
“分子运输车”
将DNA片段连接起来
将体外重组好的DNA分子导入受体细胞
限制性内切核酸酶
DNA连接酶
基因进入受体细胞的载体
【易错警示】工具酶≠工具
基因工程的基本工具
一、限制性内切核酸酶—“分子手术刀”
切割DNA分子的工具是限制性内切核酸酶,又称 。
1.来源:
2.种类:
主要来自原核生物
限制酶
数千种
限制酶不是一种酶,而是一类酶
3.作用特点:
专一性
能识别双链DNA分子的特定核苷酸序列,并使每一条链中特定部位的磷酸二酯键断开。
限制酶
限制酶
切割的是什么?
两个脱氧核苷酸之间的磷酸二酯键
氢键自动断开
4.识别序列:
EcoR Ⅰ
5’…G-A-A-T-T-C…3’
3’…C-T-T-A-A-G…5’
Sma Ⅰ
5’…C-C-C-G-G-G…3’
3’…G-G-G-C-C-C…5’
BamH Ⅰ
5’…G-G-A-T-C-C…3’
3’…C-C-T-A-G-G…5’
Taq Ⅰ
5’……T-C-G-A……3’
3’……A-G-C-T……5’
限制酶所识别的序列的特点是:呈现碱基互补对称,无论是6个碱基还是4个碱基,都可以找到一条中心轴线,中轴线两侧的双链DNA上的碱基是反向对称重复排列的,称为回文序列。
在切割部位,一条链从5’往3’读的碱基顺序与另一条链5’往3’读的顺序完全一致。
一、限制性内切核酸酶—“分子手术刀”
黏性末端    
黏性末端
EcoRI限制酶的切割
只能识别GAATTC序列,并在G和A之间切开。
一.重组DNA技术的基本工具----限制酶
平末端   平末端
SmaI限制酶的切割
只能识别CCCGGG序列,并在C和G之间切开
一.重组DNA技术的基本工具----限制酶
一、限制性内切核酸酶—“分子手术刀”
5.切割结果:
产生黏性末端或平末端
推断限制酶切一次:
断开 个磷酸二酯键,产生 个游离的磷酸基团,产生 个黏性末端,
消耗 分子水。

2
2

6. 种类与命名:
现在已经从约300种微生物中分离出了约
4000种限制性内切酶(限制酶)。
EcoRⅠ
SmaⅠ
粘质沙雷氏杆菌
(Serratia marcesens)
大肠杆菌
(Escherichia coli R)
练习:流感嗜血杆菌的d菌株
( Haemophilus influenzae d )中先后分离到3种限制酶,则分别命名为:
HindⅠ、HindⅡ和HindⅢ
写出下列限制酶切割形成的黏性末端
BamH Ⅰ:
-G
-CCTAG
*思考:你从中发现什么现象了?
不同的限制酶可能切割形成相同的黏性末端。
5'
3'
5'
3'
5'
3'
5'
3'
3'
5'
5'
3'
5'
5'
3'
3'
GATCC-
G-
Bgl Ⅱ:
EcoR Ⅰ:
-G
-CTTAA
AATTC-
G-
形成的黏性末端(从5’往3’读)
Hind Ⅲ:
-A
-TTCGA
AGCTT-
A-
-A
-TCTAG
GATCT-
A-



1.要想获得某个特定性状的基因必须要用限制酶切几个切口?
可产生几个黏性末端?
要切两个切口,产生四个黏性末端。
2.如果把两种来源不同的DNA用同一种限制酶来切割,会怎样呢?
会产生相同的黏性末端
3.限制酶能切开RNA分子的磷酸二酯键吗?
不能。限制酶只能识别并切开双链DNA分子。
思考
同种限制酶切割产生的黏性末端相同;不同限制酶切割,产生的黏性末端可能相同,也可能不同。
技巧:图片倒转180°,完全相同则为同一种限制酶切割
下列黏性末端最可能由同种限制酶切割而成的是( )
① ②
③      ④
                  
A.①② B.①③ C.①④ D.②③
B
一.重组DNA技术的基本工具----限制酶
①判断两个末端是否为同一种限制酶切割产生的方法:将其中一个末端旋转180度,若与另一个完全相同,则说明两个末端是用同一种限制酶切割
②两个末端若是由同一种限制酶切割产生的,则两个片段连接后还具有该种限制酶的识别序列和切割位点
-G
-CCTAG
GATCT-
A-
GATCC-
G-
请判断:以下黏性末端是由 种限制酶作用产生的。



3
若为同种限制酶,则切割形成的黏性末端及切割位点应相同。
【P71旁栏思考题】限制酶存在于原核生物中的作用是什么?
原核生物易受自然界外源DNA的入侵,但生物在长期的进化过程中形成了一套完善的防御机制,以防止外来病原物的侵害。限制酶就是细菌的一种防御性工具,当外源DNA侵入时,会利用限制酶将外源DNA切割掉,以保证自身的安全。所以,限制酶在原核生物中主要起到切割外源DNA、起防御作用。
原核细胞DNA中不存在限制酶的识别序列或能被识别的序列被修饰了。
【P74拓展应用1】为什么限制酶不切割细菌本身的DNA分子?
二、DNA连接酶—“分子缝合针”
1.作用:
2.种类:
将双链DNA片段“缝合”起来,恢复被限制酶切开的两个核苷酸之间的磷酸二酯键。
类型 E.coli DNA连接酶 T4 DNA连接酶
来源
功能 只缝合____________ 缝合__________和_______________
结果 恢复被限制酶切开的两个核苷酸之间的_________________ 大肠杆菌
T4噬菌体
黏性末端
黏性末端
平末端(效率低)
磷酸二酯键
注意:不是连接氢键
(氢键的形成不需要酶的催化)
E.coli DNA连接酶、T4 DNA连接酶
两DNA片段要具有相同的黏性末端才能拼起来
DNA聚合酶的作用
DNA连接酶与DNA聚合酶是一回事吗?
A A T T G
A
A
A
T
T
不是,连接的对象不同
A
DNA聚合酶
A
DNA聚合酶
DNA聚合酶
DNA聚合酶
DNA连接酶 DNA聚合酶
相同点 作用实质 化学本质 不 同 点 模板
作用对象
作用结果
用途
催化两个脱氧核苷酸之间形成磷酸二酯键
都是蛋白质
不需要
需要DNA的一条链作模板
形成完整的重组DNA分子
形成DNA的一条链
基因工程
DNA复制
只能将单个核苷酸连接到已有的DNA片段上,形成磷酸二酯键
在两个DNA片段之间形成磷酸二酯键
一.重组DNA技术的基本工具--DNA连接酶
旁栏思考(P72):DNA连接酶与DNA聚合酶是一回事吗?为什么?
与DNA相关的五种酶的比较
名称 作用部位 作用对象 作用结果
限制酶
DNA连接酶
DNA聚合酶
DNA(水解)酶
解旋酶
磷酸二酯键
磷酸二酯键
磷酸二酯键
磷酸二酯键
碱基对之间
的氢键
DNA
DNA片段
单个的脱氧
核苷酸
DNA
DNA
将DNA切成两个片段,形成
黏性末端或平末端
将两个DNA片段连接为一个DNA分子
将单个脱氧核苷酸依次连接到单链末端,形成新的DNA分子
将DNA片段水解为单个脱氧核苷酸
将双链DNA分子局部解旋为单链,形成两条长链
思考3:Bt基因是否可以直接导入到棉花细胞(受体细胞)?为什么?
否,目的基因直接导入受体细胞可能会被细胞中的酶降解或不能复制、表达。
思考4:有没有什么DNA分子可以进入宿主细胞并复制表达?
三、基因进入受体细胞的载体—“分子运输车”
1.作用:
2.种类:
质粒、噬菌体和动植物病毒等。
将目的基因转入受体细胞,在受体细胞内对目的基因进行大量复制。
种类 用途 不同点
质粒、噬菌体
植物病毒 动物病毒 将外源基因导入大肠杆菌
等受体细胞
将外源基因导入植物细胞
将外源基因导入动物细胞
来源不同,在大小、结构、复制方式以及可以插入外源DNA片段的大小也有很大差别
3.最常用的载体——质粒
一种裸露的、结构简单、独立于真核细胞细胞核或原核细胞拟核DNA之外,并具有自我复制能力的环状双链DNA分子。
标记基因
其基因属于细胞质基因。
三、基因进入受体细胞的载体—“分子运输车”
标记基因:①抗生素抗性基因②荧光蛋白基因
三、基因进入受体细胞的载体—“分子运输车”
4.运载体需具备的条件:
①在受体细胞中稳定存在并能自我复制
或整合到受体DNA上,随受体DNA同
步复制;
②有一个至多个限制酶切割位点,
便于插入(携带)目的基因;
③具有标记基因,便于筛选含有重组
DNA分子的细胞;
④对受体细胞无害、易分离。
真正被用作载体的质粒,都是在天然质粒的基础上进行过人工改造的。
霍乱弧菌的质粒有多个限制酶切位点,你会用它做载体吗?
如何确定目的基因是否进入受体细胞了?
载体上的标记基因一般是某种抗生素的抗性基因,而受体细胞没有抵抗该抗生素的能力。将含有某抗生素抗性基因的载体导入受体细胞,抗性基因在受体细胞内表达,受体细胞对该抗生素产生抗性。在含有该抗生素的培养基上,能够生存的是被导入了载体的受体细胞。
标记基因的筛选原理
思考·讨论:重组DNA分子
请你根据图3-3中的相关信息找到两条片段上EcoRI 的识别序列和切割位点。 然后,用剪刀进行“切割”。待切割位点全部切开后,将从下面那条DNA链上切下的片段重组到上面那条DNA链的切口处,并用透明胶条将切口粘连起来。
…TATCGTACGATAGGTACTTAA
…ATAGCATGCTATCCATG
AATTCGGCATAC…
GCCGTATG…
…TCCTAG
…AGGATCTTAA
GAGCCATACTTAA
AATTCTCGGTATG
AATTCCATAC…
GGTATG…
GAGCCATACTTAA
AATTCTCGGTATG
1、剪刀和透明胶条分别代表哪种“分子工具”?
剪刀代表限制酶;透明胶条代表DNA连接酶。
如果制作的黏性末端的碱基不能互补配对,可能是剪切位点或连接位点选得不对,也可能是其他原因。
不能,因为基因的长度一般在100个碱基对以上。
2、你制作的黏性末端的碱基能不能互补配对?如果不能,可能是什么原因造成的?
3、你插入的DNA片段能称得上一个基因吗?
…TATCGTACGATAGGTACTTAA
…ATAGCATGCTATCCATG
AATTCGGCATAC…
GCCGTATG…
GAGCCATACTTAA
AATTCTCGGTATG
4、从以上操作可推知,在切割含“目的片段”的DNA分子时,需用限制酶切割____次此DNA分子,产生____个黏性末端。
2
4
链状DNA分子
1个酶切割位点,若用限制酶完全切割完后形成____个DNA片段
2个酶切割位点,若用限制酶完全切割完后形成____个DNA片段
环状DNA分子
1个酶切割位点,若用限制酶完全切割完后形成____个DNA片段
2个酶切割位点,若用限制酶完全切割完后形成____个DNA片段
2
3
2
1
用相同的限制酶切割目的基因和运载体。
产生相同末端,便于连接。
5.目的基因是要与运载体结合的,那如何
处理质粒?
★重组质粒的形成:
用相同的限制酶处理目的基因和运载体,获得相同的末端,然后用DNA连接酶对其进行连接。
思考讨论
思考:
1.如果用一种限制酶分别切割目的基因和质粒,再用DNA连接酶处理后会出现几种产物?(只考虑两两结合)
①目的基因-目的基因连接
③目的基因-质粒连接
②质粒-质粒连接
④目的基因自身环化
⑤质粒自身环化
结论:为避免目的基因和质粒的自身环化及目的基因与质粒的反向连接,可使用两种不同的限制酶切割目的基因和质粒
双酶切法
技能提升
(1)获取目的基因和切割载体时, 通常使用同种限制酶,目的是为了
。但是使用该法缺点是容易发生
以及 ,为了避免上述情况发生,可采取的措施是

产生相同的黏性末端,便于连接
目的基因与质粒反向连接
目的基因、质粒的自身环化
分别使用两种限制酶(双酶切法)去切割目的基因和载体
(2)获取一个目的基因需限制酶切割 次,共产生 个游离的磷酸基团。

4
思考讨论
(3)选择限制酶切割位点的基本原则:
①切割目的基因时: 。
②切割质粒时: 。
能切下目的基因且不破坏目的基因
至少保留一个完整的标记基因,便于筛选
思考讨论
限制酶
DNA连接酶
载体
①对受体细胞无害;
②有一个至多个限制酶切割位点;
③有特殊的标记基因;
④能自我复制或能整合到宿主DNA上。
质粒、 λ噬菌体衍生物 、动植物病毒
基因工程的基本工具
作为载体的条件
种类:
磷酸二酯键
来源:
主要来源于原核生物
特点:
作用部位:
具有专一性
结果:
形成黏性末端或平末端
连接部位:磷酸二酯键
种类: E.coliDNA连接酶、T4 DNA连接酶
作用:把两条双链DNA片段拼接起来
课堂小结
DNA的粗提取与鉴定
0
0.14
NaCI浓度(mol/L)
1.实验原理
利用DNA与RNA、蛋白质和脂质等在物理和化学性质方面的差异,提取DNA,去除其他成分。
DNA不溶于酒精,
但某些蛋白质溶于酒精
DNA能溶于物质的量浓度为2 mol/L的NaCl溶液
在一定温度下,
DNA被二苯胺试剂染成蓝色
初步分离DNA和蛋白质
溶解DNA
鉴定DNA
DNA的粗提取与鉴定
2.材料用具
(1)材料:
富含DNA的材料(如新鲜洋葱、香蕉、菠菜和猪肝等)、研磨液、体积分数为95%的酒精、2 mol/L的NaCl溶液、二苯胺试剂和蒸馏水等。
(2)用具:
烧杯、量筒、玻璃棒、研钵、纱布、漏斗、试管、试管架、试管夹、酒精灯、石棉网、三脚架、火柴、刀片和天平等。
不能选择哺乳动物成熟的红细胞,因为哺乳动物成熟的红细胞中没有细胞核和线粒体,几乎不含DNA。
研磨液成分 作用
SDS 使蛋白质变性
EDTA 抑制DNA酶
Tris-HCl缓冲液 稳定DNA
析出DNA
溶解DNA
鉴定DNA
3.方法步骤
(1)通过研磨释放 DNA
称取约30g 洋葱,切碎,然后放入研钵中,倒入10 mL 研磨液,充分研磨(可加入少量石英砂助研)。
①研磨的目的:
②研磨时间不宜太长:
③有条件的可以在材料处理的过程中加入纤维素酶、果胶酶:
④研磨不宜太用力
DNA的粗提取与鉴定
破碎细胞,使核物质容易溶解在研磨液中
防止研磨时产生的热量影响DNA的提取量
研磨效果好(有利于充分研磨)
3.方法步骤
(2)过滤获取含DNA的上清液
DNA的粗提取与鉴定
可能含有核蛋白、多糖等杂质
在漏斗中垫上纱布,将洋葱研磨液过滤到烧杯中,在4℃冰箱中放置几分钟后,再取上清液。也可以直接将研磨液倒入塑料离心管中,在1500 r / min 的转速下离心5 min ,再取上清液放入烧杯中。
过滤能用滤纸代替吗?
低温放置几分钟的作用:
①可抑制核酸水解酶的活性,进而抑制DNA降解;
②抑制DNA分子运动,使DNA易形成沉淀析出;
③低温有利于增加DNA的柔韧性,减少其断裂。
不可以,因为DNA会被吸附到滤纸上而大量损失。
在上清液中加入体积相等的、预冷的酒精溶液(体积分数为95%),静置2~3 min,溶液中出现的白色丝状物就是粗提取的DNA。用玻璃棒沿一个方向搅拌,卷起丝状物,并用滤纸吸去上面的水分;或者将溶液倒入塑料离心管中,在10000r/min的转速下离心5min,弃上清液,将管底的沉淀物(粗提取的DNA)晾干。
减少DNA断裂,以便获得较完整的DNA分子。
①抑制核酸水解酶活性,防止DNA降解;
②低温有利于增加DNA分子柔韧性,减少断裂。
③使蛋白质溶解在酒精中,DNA不溶于酒精而析出。
(3)冷却酒精析出DNA
3.方法步骤
DNA的粗提取与鉴定
(4)DNA的鉴定
取两支20mL的试管,各加入2mol/L的NaCl溶液5mL。将丝状物或沉淀物溶于其中一支试管的NaCI溶液中。向两支试管中各加入4mL的二苯胺试剂。混合均匀后,将试管置于沸水中加热5min。待试管冷却后,比较两支试管中溶液颜色的变化。
加入2mol/L氯化钠溶液
不加入丝状物
加入4mL二苯胺试剂
加入2mol/L氯化钠溶液
加入丝状物
加入4mL二苯胺试剂
实验组
水浴加热
对照组
溶液蓝色的深浅与溶液中DNA的含量的多少有关
3.方法步骤
DNA的粗提取与鉴定
4.结果分析
DNA的粗提取与鉴定
鉴定结果不明显的可能原因:
①材料中的核物质没有充分释放出来,如研磨不充分或蒸馏水的量不够。②加入酒精后摇动或搅拌时过猛,DNA被破坏。
③二苯胺最好现用现配,否则二苯胺变色,影响鉴定效果。
1.怎么确认实验提取出来的是DNA所含杂质较少?若鉴定结果呈现蓝色比
较浅,说明什么问题?
观察提取的DNA的颜色,如果不是白色丝状物,说明DNA中的杂质较多。
4.进一步探究
DNA的粗提取与鉴定
为了提纯DNA,某同学提出以下实验方案,请分析原因:
操作2:上述得到的DNA提取液,缓缓加入蒸馏水,调节NaCl溶液的浓度为0.14mol/L,玻璃棒搅拌,析出DNA。
操作1:得到的DNA粗提取物(丝状物或沉淀)加入2mol/L的NaCl溶液溶解,过滤,取滤液(DNA提取液)。
用高盐浓度的溶液溶解DNA,能除去在高盐溶液中不能溶解的杂质;
用低盐溶液使DNA析出,能除去溶解在低盐溶液中的杂质。
因此,通过反复溶解与析出DNA,就能够除去与DNA溶解度不同的多种杂质。
5.进一步探究
0
0.14
NaCI浓度(mol/L)
DNA的粗提取与鉴定
5.进一步探究
方法二:可以先添加质量分数为25%的SDS溶液,使蛋白质变性后与DNA分开;随后,加入氯仿—异丙醇混合液(体积比为24:1),通过离心将蛋白质及其他杂质除去,取上清液;可重复上述操作几次,直至上清液变成透明的黏稠液体。
方法三:由于苯酚可以迅速使蛋白质变性,抑制核酸酶的活性,因此还可以先用苯酚处理,然后离心分层,这时DNA溶于上层水相,蛋白质变性后存在于酚层中,用吸管、微量移液器等实验用具就可以将两者分开。
练习与应用
一、概念检测
1. DNA连接酶是重组DNA技术常用的一种工具酶。下列相关叙述正确的是( )
A.能连接DNA分子双链碱基对之间的氢键
B.能将单个脱氧核苷酸加到DNA片段的末端,形成磷酸二酯键
C.能连接用同种限制酶切开的两条DNA片段,重新形成磷酸二酯键
D.只能连接双链DNA片段互补的黏性末端,不能连接双链DNA片段的平末端
2.在重组DNA技术中,将外源基因送入受体细胞的载体可以是( )
A.大肠杆菌的质粒 B.切割DNA分子的酶
C.DNA片段的黏性末端 D.用来识别特定基因的DNA探针
C
A
【扩展应用】有2个不同来源的DNA片段A和B,A片段用限制酶切speⅠ进行切割,B片段分别用限制酶HindⅢ, XbaⅠ、EcoRⅤ和XhoⅠ进行切割。各限制酶的识别序列和切割位点如下。
(1)哪种限制酶切割B片段产生的DNA片段能与限制酶speⅠ切割A片段产生的DNA片段相连接?为什么?
XbaⅠ。
因为XbaⅠ与SpeⅠ切割产生了相同的黏性末端。
(2)不同的限制酶切割可能产生相同的黏性末端,这在基因工程操作中有什么意义?
识别DNA分子中不同核苷酸序列,但能切割产生相同黏性末端的限制酶被称为同尾酶。同尾酶使构建载体时,切割位点的选择范围扩大。
例如,我们选择了用某种限制酶切割载体,如果目的基因的核苷酸序列中恰好含有该限制酶的识别序列,那么用该限制酶切割含有目的基因的DNA片段时,目的基因就很可能被切断;这时可以考虑用合适的同尾酶(目的基因的核苷酸序列中不能有它的识别序列)来获取目的基因。
练习与应用

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